Jonavos rajono savivaldybės VVG teritorijos administracinį vientisumą užtikrina vietos savivaldos organizavimas seniūnijose. Jonavos rajonas suskirstytas į devynis administracinius teritorinius vienetus – seniūnijas. Jonavos rajono savivaldybės VVG teritorija aprėpia aštuonias kaimiškąsias seniūnijas.
Bukonių seniūnija
Seniūnas Kazys Damulevičius
Bukonių I seniūnaitija: seniūnaitė Dalia Freimontienė
Bukonių II seniūnaitija: seniūnaitis Vidas Urbonas
Mimainių seniūnaitija: seniūnaitis Petras Vyšniauskas
Petrašiūnų seniūnaitija: seniūnaitė Emilija Belskienė
Liepių seniūnaitija: seniūnaitis Romualdas Tamulionis
Vaivadiškių seniūnaitija: seniūnaitis Jonas Stundys
Dumsių seniūnija
Seniūnas Algirdas Paplonskis
Gaižiūnų seniūnaitija: seniūnaitis Algimantas Zakarauskas
Gulbiniškių seniūnaitija: seniūnaitis Leonardas Prakapavičius
Šveicarijos seniūnaitija: seniūnaitė Zita Riaubiškienė
Barborlaukio seniūnaitija: seniūnaitis Vismantas Bagdonas
Bartonių seniūnaitija: seniūnaitis Vilius Plytnikas
Kulvos seniūnija
Seniūnas Juozas Plukys
Batėgalos seniūnaitija: seniūnaitis Arvydas Balčiūnas
Čičinų seniūnaitija: seniūnaitis Rimantas Kubiliūnas
Kulvos seniūnaitija: seniūnaitis Jonas Chaladauskas
Preišiogalėlės seniūnaitija: seniūnaitė Dalia Aleksandravičienė
Ragožių seniūnaitija: seniūnaitis Marius Kilmanas
Rimkų seniūnaitija: seniūnaitis Liutauras Zeltinis
Ručiūnų seniūnaitija: seniūnaitis Saulius Linartas
Ruklos seniūnija
Seniūnas Gintas Jasiulionis
Vakarų seniūnaitija: seniūnaitė Liudmila Melzbakienė
Rytų seniūnaitija: Virginijus Kulys
Ruklio seniūnaitija: seniūnaitis Nikolaj Strelcov
Centro seniūnaitija: seniūnaitė Vilma Praškevičienė
Piliakalnio seniūnaitija: seniūnaitė Svetlana Kazlauskienė
Rupeikio seniūnaitija: seniūnaitė Aušra Povilaitienė
Šilų seniūnija
Seniūnė Irena Kuršatienė
Aklojo Ežero seniūnaitija: seniūnaitis Vladislovas Gradauskas
Jaugėliškių seniūnaitija: seniūnaitis Audrius Imbrasas
Ilgabradų seniūnaitija: seniūnaitė Indiana Žilinskienė
Markutiškių seniūnaitija: seniūnaitė Lena Kazlauskienė
Milagainių seniūnaitija: seniūnaitis Vladislovas Pėstininkas
Panoterių seniūnaitija: seniūnaitis Vladimiras Ževžikovas
Praulių seniūnaitija: seniūnaitė Eugenija Stučinskienė
Šilų seniūnaitija: seniūnaitis Donatas Darela
Upninkų seniūnija
Seniūnė Laimutė Alechnavičienė
Upninkėlių seniūnaitija: seniūnaitis Dainius Pilipaitis
Kunigiškių — Pakalniškių seniūnaitija: seniūnaitis Eugenijus Stanevičius
Keižonių seniūnaitija: seniūnaitis Marijonas Lipnickas
Padaigų seniūnaitija: seniūnaitis Romualdas Moročka
Upninkų seniūnaitija: seniūnaitis Vilmas Palaima
Užusalių seniūnija
Seniūnė Vijolė Šadauskienė
Veseluvkos seniūnaitija: seniūnaitė Rita Dadurkienė
Užusalių seniūnaitija: seniūnaitis Algimantas Braukyla
Išorų seniūnaitija: seniūnaitė Neringa Kušeliauskienė
Kalnėnų seniūnaitija: seniūnaitė Edita Narauskienė
Krėslynų seniūnaitija: seniūnaitė Valentina Grickevičienė
Svilonių seniūnaitija: seniūnaitis Gediminas Zakarauskas
Paskutiškių seniūnaitija: seniūnaitė Valerija Maliauskienė
Žeimių seniūnija
Seniūnas Faustas Pilipavičius
Juškonių seniūnaitija: seniūnaitė Dalė Čepkauskienė
Kuigalių seniūnaitija: seniūnaitis Algimantas Šeškas
Naujasodžio seniūnaitija: seniūnaitis Tomas Ivaškevičius
Žeimių kaimiškoji seniūnaitija: seniūnaitis Edmundas Svirskas
Žeimių miestelio seniūnaitija: seniūnaitis Liudvikas Mockus
Jonavos miesto seniūnija
Jonavos miesto seniūnas Valerijus Krugliakovas